Dans l’intermédiaire entre les chapitres 12 et 13, Néhémie retourne à Babylone. Nous ignorons combien de temps il est parti, mais quand il revient (probablement vers 430-425 av. J.-C.), le peuple était retombé dans ses travers. Tous s’étaient pourtant engagés envers Dieu sur ces questions : d’abord, ne pas se marier avec des idolâtres ; ensuite, observer soigneusement le sabbat, et troisième chose, s’occuper du temple et de son personnel an moyen de la dîme et des offrandes (Néhémie 10). Mais ils avaient méprise ces trois promesses.
Au moment où Néhémie revient, il les trouve très négligents dans leur dévotion envers Dieu. Le peuple avait cessé de retourner la dîme et les offrandes, ils s’étaient mis à utiliser les salles du temple à d’autres fins, n’observaient plus le sabbat correctement, et étaient même revenus aux mariages mixtes avec les nations environnantes. Et le comble dans tout cela, c’est que les dirigeants qu’il avait laissés avaient contribué au déclin de la relation des Israelites avec Dieu. Il n’est pas surprenant que Néhémie ait été abattu quand il découvrit combien les choses avaient changé. Mais au lieu de l’accepter, une nouvelle foi, et conformément à son caractère, il agit pour la gloire de Dieu.